Donnie Darko è un giovane problematico e intelligente che soffre di allucinazioni. Il suo amico immaginario è un enorme coniglio nero di nome Frank che gli predice la fine del mondo entro 28 giorni. Improvvisamente il motore di un misterioso aereo cade sul tetto della stanza di Donnie. A seguito dell'incidente Donnie sperimenta un accresciuto senso di cosa significhi essere vivi e da lì a poco, innamorati. Armato di un arcano testo intitolato "La filosofia dei viaggi nel tempo" ben presto Donnie scopre la propria inesplicabile capacità di dipanare i fili che tengono assieme l'universo, parallelamente alla tentazione di alterare il tempo e il destino. Che non sia solo il frutto della sua immaginazione?